Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHCBP1LQ9BZQ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms