Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMCQ9BYG8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.6 ms