Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC3Q9BY71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms