Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRA6Q9BX79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRA6Q9BX79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms