Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC94Q9BW85 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC94Q9BW85 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms