Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF1Q9BQI6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms