Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim11Q99PQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim11Q99PQ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim11Q99PQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms