Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rrbp1Q99PL5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rrbp1Q99PL5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Rrbp1Q99PL5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms