Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtn4Q99P72 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4Q99P72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms