Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird2Q99NI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird2Q99NI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms