Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BrapQ99MP8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms