Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RtcbQ99LF4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RtcbQ99LF4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RtcbQ99LF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1524.1 ms