Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF1

Akirin1, Akirin-1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin1Q99LF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Akirin1Q99LF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akirin1Q99LF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akirin1Q99LF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms