Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Reep3Q99KK1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms