Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPEPQ99797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPEPQ99797 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPEPQ99797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms