Protein–RNA interactions for Protein: Q99759

MAP3K3, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K3Q99759 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K3Q99759 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K3Q99759 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K3Q99759 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms