Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDNQ99608 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NDNQ99608 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDNQ99608 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NDNQ99608 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNQ99608 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNQ99608 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNQ99608 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNQ99608 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNQ99608 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNQ99608 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNQ99608 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNQ99608 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNQ99608 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNQ99608 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNQ99608 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNQ99608 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms