Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD4Q96M96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGD4Q96M96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms