Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms