Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERAC1Q96JX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERAC1Q96JX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERAC1Q96JX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERAC1Q96JX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERAC1Q96JX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms