Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3KBP1Q96B97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3KBP1Q96B97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms