Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKL1Q969V6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms