Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rnf144aQ925F3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Rnf144aQ925F3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Rnf144aQ925F3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rnf144aQ925F3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rnf144aQ925F3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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