Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Synpo2Q91YE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Synpo2Q91YE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms