Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm4sf4Q91XD3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tm4sf4Q91XD3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm4sf4Q91XD3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms