Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn3Q91V61 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfxn3Q91V61 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms