Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF12Q8WXF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms