Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3Q8WWT9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms