Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC4Q8WW27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms