Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms