Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCOLN3Q8TDD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms