Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IL1Q8TBN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms