Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL3Q8IZI9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFNL3Q8IZI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms