Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP9Q8IXQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms