Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPA2Q8IWL1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms