Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC83Q8IWF9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC83Q8IWF9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms