Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WDR49Q8IV35 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR49Q8IV35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR49Q8IV35 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms