Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIOX2Q8IUF8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOX2Q8IUF8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms