Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CDN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CDN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8CDN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8CDN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8CDN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8CDN1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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