Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb2Q8CC27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb2Q8CC27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms