Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc15Q8C9M2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc15Q8C9M2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms