Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr2Q8C8T8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr2Q8C8T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms