Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfrp1Q8C4U3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfrp1Q8C4U3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfrp1Q8C4U3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfrp1Q8C4U3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfrp1Q8C4U3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp1Q8C4U3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms