Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmo3Q8BZL8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmo3Q8BZL8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo3Q8BZL8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms