Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc30Q8BVF4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms