Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcl3Q8BVF2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms