Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd55Q8BLD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd55Q8BLD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd55Q8BLD6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms