Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp1Q8BJQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp1Q8BJQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms