Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttll4Q80UG8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttll4Q80UG8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms