Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcph1Q7TT79 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms